2006 m. Moterų I lygos čempionatas – Lietuvos 2 lygmens varžybos, 9 Moterų futbolo I lygos sezonas. 8 komandų varžybos prasidėjo 2006 m. ir tęsėsi iki 2006 m. spalio 13 d. Prieš šį sezoną organizuotos 2007 m. Moterų I lygos čempionato varžybos, kitą sezoną - 2013 m. Moterų I lygos finalinis etapas.
Iš viso šį sezoną buvo sužaistos 56 rungtynės, įmušti 165 įvarčiai.Ilgiausia sezono seka be pergalių – 14 rungtynių (Visagino SC - nuo 2006 m. gegužės 1 d. iki 2006 m. spalio 8 d.)Daugiausiai rungtynių nepelnant įvarčių – 8 rungtynės (Kauno FM-2 - nuo 2006 m. gegužės 27 d. iki 2006 m. spalio 13 d.)
