2006 m. Moterų A lyga – Lietuvos 1 lygmens varžybos, 8 Moterų futbolo A lygos sezonas. 8 komandų varžybos prasidėjo 2006 m. ir tęsėsi iki 2006 m. spalio 15 d. Prieš šį sezoną organizuotos 2000 m. Moterų futbolo čempionato varžybos, kitą sezoną - 1994 m. Moterų futbolo čempionatas.
Iš viso šį sezoną buvo sužaistos 54 rungtynės, įmušti 267 įvarčiai.Ilgiausia pralaimėjimų seka – 6 rungtynės (3 komandos, 4 kartus)Ilgiausia sezono seka be pergalių – 13 rungtynių (Vilniaus „Elena“ - nuo 2006 m. gegužės 9 d. iki 2006 m. spalio 15 d.)
