2003 m. LFF II lygos Šiaurės zona – LFF II lygos varžybų dalis. 9 komandų varžybos prasidėjo 2003 m. balandžio 26 d. ir tęsėsi iki 2003 m. spalio 12 d. Prieš šį sezoną organizuotos 2004 m. LFF II lygos Pietų zonos varžybos, kitą sezoną - 1999 m. LFF II lygos Rytų zona.
Iš viso šį sezoną buvo sužaistos 71 rungtynės, įmuštas 351 įvartis.Rungtynės, kuriose svečiams pavyko pelnyti daugiausiai įvarčių – 2 : 9 (2003 m. rugpjūčio 23 d. Pakruojo „Kruoja“ - Šiaulių „Universitetas“)Ilgiausia seka be pralaimėjimų – 15 rungtynių (Mažeikių FK - nuo 2003 m. gegužės 17 d. iki 2003 m. spalio 4 d.)
