2003 m. LFF II lygos Šiaurės zona – LFF II lygos varžybų dalis. 9 komandų varžybos prasidėjo 2003 m. balandžio 26 d. ir tęsėsi iki 2003 m. spalio 12 d. Prieš šį sezoną organizuotos 1999 m. LFF II lygos varžybos, kitą sezoną - 1999 m. LFF II lygos Rytų zona.
Iš viso šį sezoną buvo sužaistos 71 rungtynės, įmuštas 351 įvartis.Daugiausiai rungtynių pelnant bent vieną įvartį – 16 rungtynių (Pakruojo „Kruoja“ - nuo 2003 m. balandžio 26 d. iki 2003 m. spalio 12 d.)Ilgiausia seka be pralaimėjimų – 15 rungtynių (Mažeikių FK - nuo 2003 m. gegužės 17 d. iki 2003 m. spalio 4 d.)
