2003 m. LFF II lygos Šiaurės zona – LFF II lygos varžybų dalis. 9 komandų varžybos prasidėjo 2003 m. balandžio 26 d. ir tęsėsi iki 2003 m. spalio 12 d. Prieš šį sezoną organizuotos 1999 m. LFF II lygos varžybos, kitą sezoną - 1999 m. LFF II lygos Rytų zona.
Iš viso šį sezoną buvo sužaistos 71 rungtynės, įmuštas 351 įvartis.Ilgiausia pergalių seka – 6 rungtynės (Mažeikių FK - nuo 2003 m. rugpjūčio 30 d. iki 2003 m. spalio 4 d.)Ilgiausia sezono seka be pergalių – 8 rungtynės (Kelmės „Kražantė“ - nuo 2003 m. gegužės 10 d. iki 2003 m. rugpjūčio 23 d.)
