1990 m. Baltijos lyga – Baltijos šalio 1 lygmens varžybos, 5 Baltijos lygos sezonas. 17 komandų varžybos prasidėjo 1990 m. balandžio mėn. ir tęsėsi iki 1990 m. spalio 20 d. Prieš šį sezoną organizuotos 2007 m. Baltijos lygos varžybos, kitą sezoną - 1993-1994 m. Baltijos lyga.
Iš viso šį sezoną buvo sužaistos 268 rungtynės, įmušti 684 įvarčiai.Rungtynės, kuriose svečiams pavyko pelnyti daugiausiai įvarčių – 0 : 7 (1990 m. rugsėjo 13 d. Liepojos „Metalurgs“ - Kauno „Inkaras“)Daugiausiai rungtynių pelnant bent vieną įvartį – 14 rungtynių (Vilniaus „Žalgiris“ - nuo 1990 m. birželio 8 d. iki 1990 m. rugpjūčio 28 d.)
