1990 m. Baltijos lyga – Baltijos šalio 1 lygmens varžybos, 3 Baltijos lygos sezonas. 17 komandų varžybos prasidėjo 1990 m. balandžio mėn. ir tęsėsi iki 1990 m. spalio 20 d. Prieš šį sezoną organizuotos 2008 m. Triobet Baltijos lygos varžybos, kitą sezoną - 1993-1994 m. Baltijos lyga.
Iš viso šį sezoną buvo sužaistos 268 rungtynės, įmušti 684 įvarčiai.Šio sezono pralaimėjimas didžiausiu skirtumu – 8 : 0 (1990 m. birželio 25 d. Vilniaus „Žalgiris“ - Vilniaus „Neris“)Daugiausiai rungtynių nepelnant įvarčių – 5 rungtynės (Liepojos „Metalurgs“ - nuo 1990 m. balandžio 8 d. iki 1990 m. balandžio 29 d. ir nuo 1990 m. rugpjūčio 20 d. iki 1990 m. rugsėjo 13 d. ir Rygos „Daugava“ - nuo 1990 m. gegužės 12 d. iki 1990 m. birželio 2 d.)
