1939-1940 m. Lietuvos futbolo pirmenybės – 6 Lietuvos futbolo pirmenybių sezonas. 8 komandų varžybos prasidėjo 1940 m. ir tęsėsi iki 1940 m. birželio mėn. Prieš šį sezoną organizuotos 1929 m. Lietuvos futbolo pirmenybių varžybos, kitą sezoną - 1930 m. Lietuvos futbolo pirmenybės.
Iš viso šį sezoną buvo sužaistos 27 rungtynės, įmušti 93 įvarčiai.Daugiausiai rungtynių pelnant bent vieną įvartį – 7 rungtynės (Kauno LGSF - nuo 1939 m. iki 1939 m. ir Kauno „Tauras“ - nuo 1939 m. iki 1939 m.)Rungtynės, kuriose svečiams pavyko pelnyti daugiausiai įvarčių – 4 : 3 (1939 m. Kauno „Tauras“ - Kauno „Kovas“)